Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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