Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAAP100Q0VG06 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAAP100Q0VG06 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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