Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms