RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571722.3

SNORD3B-2-202, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-2, humanhuman

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Gene SNORD3B-2, Length 791 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.42■■■■□ 3.26
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 NACADO15069 1562 aa29.6■■■□□ 2.33
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.6■■■□□ 2.33
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 SCRIBQ14160 1630 aa28.65■■■□□ 2.18
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.41■■■□□ 2.14
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.86■■■□□ 2.05
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.71■■■□□ 2.03
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.37■■□□□ 1.97
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.29■■□□□ 1.96
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SMARCA2P51531 1590 aa27.26■■□□□ 1.96
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.19■■□□□ 1.94
SNORD3B-2-202ENST00000571722 HMGXB3Q12766 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.58■■□□□ 1.85
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 ERCC6Q03468 1493 aa26.55■■□□□ 1.84
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.45■■□□□ 1.82
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.42■■□□□ 1.82
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 CUX2O14529 1486 aa26.3■■□□□ 1.8
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.22■■□□□ 1.79
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.16■■□□□ 1.78
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.14■■□□□ 1.78
SNORD3B-2-202ENST00000571722 WDR62O43379 1518 aa26.05■■□□□ 1.76
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PRDM2Q13029 1718 aa26■■□□□ 1.75
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 IFT140Q96RY7 1462 aa25.65■■□□□ 1.7
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CUX1P39880 1505 aa25.58■■□□□ 1.69
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 SOGA1O94964 1423 aa25.52■■□□□ 1.68
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.49■■□□□ 1.67
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 TOP2BQ02880 1626 aa25.33■■□□□ 1.65
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SYNJ1O43426 1573 aa25.32■■□□□ 1.64
SNORD3B-2-202ENST00000571722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
SNORD3B-2-202ENST00000571722 OSCARQ8IYS5 282 aa25.3■■□□□ 1.64
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
SNORD3B-2-202ENST00000571722 WDR97A6NE52 1622 aa25.26■■□□□ 1.63
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.19■■□□□ 1.62
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GRIN2BQ13224 1484 aa25.18■■□□□ 1.62
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.13■■□□□ 1.61
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FBLN2P98095 1184 aa25.12■■□□□ 1.61
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.11■■□□□ 1.61
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.9■■□□□ 1.58
SNORD3B-2-202ENST00000571722 KIF27Q86VH2 1401 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.76■■□□□ 1.55
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.76■■□□□ 1.55
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.71■■□□□ 1.55
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CEP170Q5SW79 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.69■■□□□ 1.54
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SNORD3B-2-202ENST00000571722 ARAP1Q96P48 1450 aa24.6■■□□□ 1.53
SNORD3B-2-202ENST00000571722 JPH4Q96JJ6 628 aa24.59■■□□□ 1.53
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.57■■□□□ 1.52
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