Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms