Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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