Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms