Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms