Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms