Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CDKL2-202ENST00000429927 3383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 XIAPP2-201ENST00000527404 1852 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PCP4P48539 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 VIT-201ENST00000379241 2525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NTM-203ENST00000374791 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms