Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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HOXA3O43365 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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