Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TYW3Q6IPR3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TYW3Q6IPR3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms