Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TYW3Q6IPR3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TYW3Q6IPR3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TYW3Q6IPR3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TYW3Q6IPR3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TYW3Q6IPR3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TYW3Q6IPR3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TYW3Q6IPR3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TYW3Q6IPR3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TYW3Q6IPR3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TYW3Q6IPR3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TYW3Q6IPR3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TYW3Q6IPR3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TYW3Q6IPR3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TYW3Q6IPR3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TYW3Q6IPR3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TYW3Q6IPR3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TYW3Q6IPR3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TYW3Q6IPR3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TYW3Q6IPR3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TYW3Q6IPR3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TYW3Q6IPR3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYW3Q6IPR3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TYW3Q6IPR3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TYW3Q6IPR3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TYW3Q6IPR3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TYW3Q6IPR3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYW3Q6IPR3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TYW3Q6IPR3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TYW3Q6IPR3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TYW3Q6IPR3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TYW3Q6IPR3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TYW3Q6IPR3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TYW3Q6IPR3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TYW3Q6IPR3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TYW3Q6IPR3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TYW3Q6IPR3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TYW3Q6IPR3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TYW3Q6IPR3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TYW3Q6IPR3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TYW3Q6IPR3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TYW3Q6IPR3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TYW3Q6IPR3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TYW3Q6IPR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TYW3Q6IPR3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TYW3Q6IPR3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TYW3Q6IPR3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TYW3Q6IPR3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TYW3Q6IPR3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TYW3Q6IPR3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TYW3Q6IPR3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TYW3Q6IPR3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TYW3Q6IPR3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TYW3Q6IPR3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TYW3Q6IPR3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TYW3Q6IPR3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TYW3Q6IPR3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TYW3Q6IPR3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TYW3Q6IPR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TYW3Q6IPR3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TYW3Q6IPR3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TYW3Q6IPR3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TYW3Q6IPR3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TYW3Q6IPR3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TYW3Q6IPR3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TYW3Q6IPR3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TYW3Q6IPR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TYW3Q6IPR3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TYW3Q6IPR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TYW3Q6IPR3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TYW3Q6IPR3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TYW3Q6IPR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TYW3Q6IPR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TYW3Q6IPR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TYW3Q6IPR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TYW3Q6IPR3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TYW3Q6IPR3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TYW3Q6IPR3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TYW3Q6IPR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TYW3Q6IPR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TYW3Q6IPR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TYW3Q6IPR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TYW3Q6IPR3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TYW3Q6IPR3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TYW3Q6IPR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms