Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms