Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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