RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448514.1

GGTLC2-202, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-202ENST00000448514 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.42■■■■□ 3.74
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GGTLC2-202ENST00000448514 ABCC9O60706 1549 aa34.4■■■■□ 3.1
GGTLC2-202ENST00000448514 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.8■■■□□ 2.84
GGTLC2-202ENST00000448514 NACADO15069 1562 aa32.61■■■□□ 2.81
GGTLC2-202ENST00000448514 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.37■■■□□ 2.77
GGTLC2-202ENST00000448514 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.33■■■□□ 2.77
GGTLC2-202ENST00000448514 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.24■■■□□ 2.75
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GGTLC2-202ENST00000448514 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.92■■■□□ 2.7
GGTLC2-202ENST00000448514 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
GGTLC2-202ENST00000448514 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.82■■■□□ 2.68
GGTLC2-202ENST00000448514 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.8■■■□□ 2.68
GGTLC2-202ENST00000448514 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.52■■■□□ 2.64
GGTLC2-202ENST00000448514 SCRIBQ14160 1630 aa31.31■■■□□ 2.6
GGTLC2-202ENST00000448514 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
GGTLC2-202ENST00000448514 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
GGTLC2-202ENST00000448514 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.04■■■□□ 2.56
GGTLC2-202ENST00000448514 NCAPD3P42695 1498 aa30.14■■■□□ 2.42
GGTLC2-202ENST00000448514 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30■■■□□ 2.39
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GGTLC2-202ENST00000448514 SMARCA2P51531 1590 aa29.92■■■□□ 2.38
GGTLC2-202ENST00000448514 HMGXB3Q12766 1538 aa29.87■■■□□ 2.37
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GGTLC2-202ENST00000448514 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTLC2-202ENST00000448514 CUX2O14529 1486 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTLC2-202ENST00000448514 ERCC6Q03468 1493 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTLC2-202ENST00000448514 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.7■■■□□ 2.35
GGTLC2-202ENST00000448514 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
GGTLC2-202ENST00000448514 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.56■■■□□ 2.32
GGTLC2-202ENST00000448514 NESP48681 1621 aa29.56■■■□□ 2.32
GGTLC2-202ENST00000448514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.41■■■□□ 2.3
GGTLC2-202ENST00000448514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.28■■■□□ 2.28
GGTLC2-202ENST00000448514 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
GGTLC2-202ENST00000448514 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.22■■■□□ 2.27
GGTLC2-202ENST00000448514 WIZO95785 1651 aa29.15■■■□□ 2.26
GGTLC2-202ENST00000448514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.12■■■□□ 2.25
GGTLC2-202ENST00000448514 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
GGTLC2-202ENST00000448514 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTLC2-202ENST00000448514 WDR62O43379 1518 aa28.91■■■□□ 2.22
GGTLC2-202ENST00000448514 CFTRP13569 1480 aa28.88■■■□□ 2.21
GGTLC2-202ENST00000448514 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.86■■■□□ 2.21
GGTLC2-202ENST00000448514 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GGTLC2-202ENST00000448514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.84■■■□□ 2.21
GGTLC2-202ENST00000448514 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.54■■■□□ 2.16
GGTLC2-202ENST00000448514 PRDM2Q13029 1718 aa28.43■■■□□ 2.14
GGTLC2-202ENST00000448514 OSCARQ8IYS5 282 aa28.41■■■□□ 2.14
GGTLC2-202ENST00000448514 TRIM41Q8WV44 630 aa28.34■■■□□ 2.13
GGTLC2-202ENST00000448514 IFT140Q96RY7 1462 aa28.33■■■□□ 2.13
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCC8Q09428 1581 aa28.29■■■□□ 2.12
GGTLC2-202ENST00000448514 TOPBP1Q92547 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GGTLC2-202ENST00000448514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.17■■■□□ 2.1
GGTLC2-202ENST00000448514 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
GGTLC2-202ENST00000448514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
GGTLC2-202ENST00000448514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GGTLC2-202ENST00000448514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
GGTLC2-202ENST00000448514 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.92■■■□□ 2.06
GGTLC2-202ENST00000448514 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.92■■■□□ 2.06
GGTLC2-202ENST00000448514 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.92■■■□□ 2.06
GGTLC2-202ENST00000448514 SOGA1O94964 1423 aa27.9■■■□□ 2.06
GGTLC2-202ENST00000448514 ARHGEF11O15085 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
GGTLC2-202ENST00000448514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.87■■■□□ 2.05
GGTLC2-202ENST00000448514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.8■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 WDR97A6NE52 1622 aa27.8■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 CUX1P39880 1505 aa27.78■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 FBLN2P98095 1184 aa27.78■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 CHD1O14646 1710 aa27.77■■■□□ 2.04
GGTLC2-202ENST00000448514 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.69■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.69■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 GRIN2BQ13224 1484 aa27.65■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
GGTLC2-202ENST00000448514 ARAP1Q96P48 1450 aa27.6■■■□□ 2.01
GGTLC2-202ENST00000448514 SYNJ2O15056 1496 aa27.57■■■□□ 2
GGTLC2-202ENST00000448514 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.56■■■□□ 2
GGTLC2-202ENST00000448514 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.55■■■□□ 2
GGTLC2-202ENST00000448514 SYNJ1O43426 1573 aa27.54■■■□□ 2
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.53■■■□□ 2
GGTLC2-202ENST00000448514 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.44■■□□□ 1.98
GGTLC2-202ENST00000448514 PBRM1Q86U86 1689 aa27.42■■□□□ 1.98
GGTLC2-202ENST00000448514 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
GGTLC2-202ENST00000448514 TOP2BQ02880 1626 aa27.34■■□□□ 1.97
GGTLC2-202ENST00000448514 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.32■■□□□ 1.96
GGTLC2-202ENST00000448514 GRIN2AQ12879 1464 aa27.28■■□□□ 1.96
GGTLC2-202ENST00000448514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.23■■□□□ 1.95
GGTLC2-202ENST00000448514 ADAMTS12P58397 1594 aa27.22■■□□□ 1.95
GGTLC2-202ENST00000448514 NUP160Q12769 1436 aa27.22■■□□□ 1.95
GGTLC2-202ENST00000448514 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.19■■□□□ 1.94
GGTLC2-202ENST00000448514 CEP170Q5SW79 1584 aa27.14■■□□□ 1.93
GGTLC2-202ENST00000448514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.06■■□□□ 1.92
GGTLC2-202ENST00000448514 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
GGTLC2-202ENST00000448514 JPH4Q96JJ6 628 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-202ENST00000448514 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GGTLC2-202ENST00000448514 IGF1RP08069 1367 aa26.87■■□□□ 1.89
GGTLC2-202ENST00000448514 KIF27Q86VH2 1401 aa26.85■■□□□ 1.89
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