Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms