Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NDUFAF3Q9BU61 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NDUFAF3Q9BU61 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms