Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LTC4SQ16873 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms