Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms