Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
HCG22E2RYF7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HCG22E2RYF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms