Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC1P48995 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC1P48995 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC1P48995 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms