Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms