Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms