Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF1Q9UMS5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms