Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROTQ9UKG9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms