Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3DQ96BQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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FAM3DQ96BQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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FAM3DQ96BQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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FAM3DQ96BQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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