Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRAT1Q92837 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FRAT1Q92837 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRAT1Q92837 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRAT1Q92837 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRAT1Q92837 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRAT1Q92837 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRAT1Q92837 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms