Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUDCD3Q8IVD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms