Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.285e-12■■■■□ 25.2
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SND1Q7KZF4 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 25
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SND1Q7KZF4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 24.8
SND1Q7KZF4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.328e-7■■■■□ 24.8
SND1Q7KZF4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.188e-7■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-12■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.812e-12■■■■□ 24.8
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