Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPPQ6IPU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms