Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNJQ5T5M9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNJQ5T5M9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNJQ5T5M9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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