Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCNJQ5T5M9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCNJQ5T5M9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCNJQ5T5M9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCNJQ5T5M9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNJQ5T5M9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNJQ5T5M9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCNJQ5T5M9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCNJQ5T5M9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCNJQ5T5M9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCNJQ5T5M9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNJQ5T5M9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNJQ5T5M9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCNJQ5T5M9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNJQ5T5M9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNJQ5T5M9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNJQ5T5M9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNJQ5T5M9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNJQ5T5M9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNJQ5T5M9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNJQ5T5M9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNJQ5T5M9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNJQ5T5M9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNJQ5T5M9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNJQ5T5M9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNJQ5T5M9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNJQ5T5M9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNJQ5T5M9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNJQ5T5M9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNJQ5T5M9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNJQ5T5M9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNJQ5T5M9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNJQ5T5M9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNJQ5T5M9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNJQ5T5M9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNJQ5T5M9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNJQ5T5M9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNJQ5T5M9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNJQ5T5M9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNJQ5T5M9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNJQ5T5M9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNJQ5T5M9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNJQ5T5M9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNJQ5T5M9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNJQ5T5M9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNJQ5T5M9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNJQ5T5M9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNJQ5T5M9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNJQ5T5M9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNJQ5T5M9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNJQ5T5M9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNJQ5T5M9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNJQ5T5M9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNJQ5T5M9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNJQ5T5M9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNJQ5T5M9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNJQ5T5M9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNJQ5T5M9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNJQ5T5M9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNJQ5T5M9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNJQ5T5M9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNJQ5T5M9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNJQ5T5M9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNJQ5T5M9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNJQ5T5M9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNJQ5T5M9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNJQ5T5M9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCNJQ5T5M9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNJQ5T5M9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNJQ5T5M9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNJQ5T5M9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNJQ5T5M9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNJQ5T5M9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNJQ5T5M9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNJQ5T5M9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJQ5T5M9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJQ5T5M9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJQ5T5M9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJQ5T5M9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNJQ5T5M9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNJQ5T5M9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNJQ5T5M9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNJQ5T5M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNJQ5T5M9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNJQ5T5M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJQ5T5M9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJQ5T5M9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNJQ5T5M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNJQ5T5M9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJQ5T5M9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNJQ5T5M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNJQ5T5M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNJQ5T5M9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNJQ5T5M9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNJQ5T5M9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms