Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAPPAQ13219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PAPPAQ13219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAPPAQ13219 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
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