Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FMODQ06828 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FMODQ06828 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FMODQ06828 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FMODQ06828 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FMODQ06828 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FMODQ06828 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FMODQ06828 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FMODQ06828 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FMODQ06828 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FMODQ06828 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FMODQ06828 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FMODQ06828 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FMODQ06828 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FMODQ06828 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FMODQ06828 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FMODQ06828 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms