Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID5AQ03989 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID5AQ03989 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms