Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID5AQ03989 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARID5AQ03989 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID5AQ03989 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID5AQ03989 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID5AQ03989 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID5AQ03989 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID5AQ03989 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID5AQ03989 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID5AQ03989 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID5AQ03989 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID5AQ03989 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID5AQ03989 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID5AQ03989 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID5AQ03989 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID5AQ03989 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID5AQ03989 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID5AQ03989 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID5AQ03989 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID5AQ03989 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID5AQ03989 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARID5AQ03989 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARID5AQ03989 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID5AQ03989 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID5AQ03989 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID5AQ03989 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID5AQ03989 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID5AQ03989 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID5AQ03989 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID5AQ03989 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARID5AQ03989 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARID5AQ03989 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARID5AQ03989 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARID5AQ03989 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID5AQ03989 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARID5AQ03989 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARID5AQ03989 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARID5AQ03989 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARID5AQ03989 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARID5AQ03989 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARID5AQ03989 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID5AQ03989 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID5AQ03989 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID5AQ03989 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID5AQ03989 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID5AQ03989 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID5AQ03989 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID5AQ03989 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID5AQ03989 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID5AQ03989 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID5AQ03989 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID5AQ03989 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID5AQ03989 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID5AQ03989 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID5AQ03989 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID5AQ03989 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID5AQ03989 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID5AQ03989 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID5AQ03989 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARID5AQ03989 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARID5AQ03989 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARID5AQ03989 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ARID5AQ03989 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ARID5AQ03989 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ARID5AQ03989 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ARID5AQ03989 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ARID5AQ03989 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ARID5AQ03989 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ARID5AQ03989 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ARID5AQ03989 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ARID5AQ03989 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARID5AQ03989 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ARID5AQ03989 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ARID5AQ03989 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARID5AQ03989 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARID5AQ03989 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID5AQ03989 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID5AQ03989 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID5AQ03989 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ARID5AQ03989 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARID5AQ03989 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID5AQ03989 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID5AQ03989 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID5AQ03989 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID5AQ03989 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID5AQ03989 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ARID5AQ03989 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARID5AQ03989 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ARID5AQ03989 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARID5AQ03989 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARID5AQ03989 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ARID5AQ03989 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID5AQ03989 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID5AQ03989 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARID5AQ03989 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARID5AQ03989 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARID5AQ03989 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARID5AQ03989 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARID5AQ03989 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARID5AQ03989 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms