Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLTPP55058 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLTPP55058 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLTPP55058 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLTPP55058 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLTPP55058 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLTPP55058 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLTPP55058 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLTPP55058 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLTPP55058 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLTPP55058 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLTPP55058 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLTPP55058 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLTPP55058 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLTPP55058 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLTPP55058 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLTPP55058 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLTPP55058 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLTPP55058 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLTPP55058 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms