Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM1P23921 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRM1P23921 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM1P23921 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM1P23921 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM1P23921 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM1P23921 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM1P23921 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM1P23921 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM1P23921 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM1P23921 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM1P23921 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM1P23921 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM1P23921 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM1P23921 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM1P23921 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM1P23921 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM1P23921 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM1P23921 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM1P23921 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM1P23921 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM1P23921 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM1P23921 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms