Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG2P13727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG2P13727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG2P13727 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG2P13727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG2P13727 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG2P13727 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRG2P13727 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG2P13727 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG2P13727 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRG2P13727 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRG2P13727 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG2P13727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG2P13727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG2P13727 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG2P13727 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRG2P13727 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG2P13727 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG2P13727 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG2P13727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms