Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XRCC5P13010 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC5P13010 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC5P13010 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XRCC5P13010 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms