Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH1P12830 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH1P12830 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH1P12830 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH1P12830 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH1P12830 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH1P12830 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH1P12830 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH1P12830 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH1P12830 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH1P12830 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH1P12830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH1P12830 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH1P12830 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH1P12830 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH1P12830 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH1P12830 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH1P12830 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH1P12830 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH1P12830 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH1P12830 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH1P12830 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH1P12830 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH1P12830 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms