Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD2O60548 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms