Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms