Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC78A2IDD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC78A2IDD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms