Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HFEQ30201 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HFEQ30201 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HFEQ30201 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
HFEQ30201 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HFEQ30201 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HFEQ30201 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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HFEQ30201 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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HFEQ30201 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HFEQ30201 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HFEQ30201 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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