Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms