Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ME2P23368 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ME2P23368 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ME2P23368 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms