Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCP1P17987 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms