Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms